primer dizisinin (G ve C sayısı )GC içeriği inceleyin . GC bağlama nedeniyle guanin ve sitozin arasındakiek hidrojen bağının bağlanması göre daha güçlüdür. Optimal yapıştırma en az yüzde 50 GC içeriği olduğunu.
2
reaksiyontavlama sıcaklığını inceleyin . Düşük tavlama sıcaklıkları , genel olarak 55 ° C gibi tanımlanmıştır ya da yanlış genomik bölümlerden amplifikasyon ek olarak astar dimerler neden olabilirprimerin spesifik olmayan bağlanma neden olabilir.
3
Çift Eğer PCR eklenen primerlerin miktarı ve konsantrasyonu kontrol ediniz. Primerler , genellikle fazla 75 pikomol , aşırı bir yanı , astar dimerlerini neden olabilir .