Agaroz jel elektroforez yükleme numunede bulunanfragmanlarının boyutuna göre DNA moleküllerini ayırır. " Çukurlar " olarak adlandırılanjel üstünde küçük delikler , incelenecek olan DNA'yı içeren sıvı ile yüklenir. Jelin Bu sonanot yerleştirilir , ya da negatif elektrik kaynağını tahsil edilir .
Küçük Fragmanlar
DNA fragmanlarıkatot doğru çekilmiş , ya da pozitif yüklü elektrik kaynağı . Molekülleri agaroz jeli içinden göç olarak, büyüklüğüne göre ayrılması için başlar. DNAküçük fragmanlarıdüşük molekül ağırlığına sahip bileşiklerdir; Bu fragmanlarjel katod ucuna doğru hareket etmeyehızlı bulunmaktadır.
Büyük parçalar
DNA fragmanları büyür ve daha yüksek molekül ağırlıklarına sahip olan gibi, onlarkatot doğruagaroz jel üzerinde hareket etmek için yavaştır; DNAküçük fragmanları katod ucuna yakın bulunan ise , bu nedenle , büyük DNAfragmanları, jelin anot sonuna yakın bulunurlar.
Görselleştirme
DNA, fragmanları, etidyum bromür adı verilen özel bir kimyasal ile boyanarak bir ultraviyole ışık kaynağı altında görselleştirilebilir. UV radyasyonuna maruz kaldığında ışık, parçalı DNAmerdiveninaltındakimerdiveninüstündeki DNAağır ve en büyük fragmanları vehafif, en küçük DNA parçaları ile , bir merdiven oluşumu görünecektir .